История университета начинается с 1906 года. Тогда под влиянием прогрессивной общественности были организованы Московские женские курсы. Затем курсы преобразовали во 2-й Московский государственный университет, из которого в 1930 году выделился самостоятельный 2-й Московский государственный медицинский институт, получивший в 1956 году имя великого русского хирурга и анатома Николая Ивановича Пирогова (1810-1881 гг.)
Н. И. Пирогов заложил основы военно-полевой хирургии и хирургической анатомии, руководил хирургическими клиниками Дерптского (ныне Тартуского) университета, а затем Петербургской медико-хирургической академии. Н. И. Пирогов был крупным организатором военно-медицинской науки, много внимания уделял созданию нового хирургического инструментария и хирургических наборов для армии. Н.И. Пирогов первым применил наркоз в полевых условиях действующей армии во время хирургической операции. Но особенно ярко его лучшие организаторские и врачебные качества проявились в ходе обороны города Севастополя. Много сил отдавал он подготовке молодых врачей и воспитанию научно-медицинских кадров. Жизнь Н.И. Пирогова - пример бескорыстного служения науке и Отчизне.
5 ноября 1991 года распоряжением Совета Министров Российской Федерации 2-й МОЛГМИ им. Н. И Пирогова был преобразован в Российский государственный медицинский университет. Этот документ подтверждает ведущую роль университета в качестве учебно-методического, научно-медицинского и лечебного центра России.
В 2011 году приказом Министерства здравоохранения и социального развития Российской Федерации Российский государственный медицинский университет переименован в Российский национальный исследовательский медицинский университет им. Н. И. Пирогова.
Официальный сайт: http://rsmu.ru